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Text File  |  1995-03-04  |  2.2 KB  |  40 lines
  1. *****************************************************************************
  2. * Alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase signatures *
  3. *****************************************************************************
  4.  
  5. The following   dehydrogenases   have  been  shown [1]  to  share  regions  of
  6. similarity:
  7.  
  8.  - Alanine dehydrogenase (EC 1.4.1.1),  an enzyme  which  catalyzes  the  NAD-
  9.    dependent reversible reductive amination of pyruvate into alanine.
  10.  - Pyridine nucleotide transhydrogenase (EC 1.6.1.1), which is the enzyme that
  11.    catalyzes the reduction of NADP+ to NADPH with the concomitant oxidation of
  12.    NADH to NAD+. This enzyme is located  in the plasma membrane of prokaryotes
  13.    and  in  the  inner  membrane  of  the  mitochondria  of  eukaryotes.   The
  14.    transhydrogenation between NADH and NADP is coupled with the  translocation
  15.    of a proton across the membrane.  In prokaryotes  the enzyme is composed of
  16.    two different subunits:  an alpha chain (gene pntA)  and a beta chain (gene
  17.    pntB) while in eukaryotes it is a single chain protein.
  18.  
  19. The sequence  of  alanine  dehydrogenase  from  several  bacterial species are
  20. related with  those of the  alpha subunit  of  bacterial  pyridine  nucleotide
  21. transhydrogenase and of the N-terminal half of the eukaryotic enzyme.  The two
  22. most conserved regions correspond respectively  to the N-terminal extremity of
  23. these proteins and  to  a  central  glycine-rich  region  which is part of the
  24. NAD(H)-binding site. We have developed signature patterns for both regions.
  25.  
  26. -Consensus pattern: G-[LIVM]-P-x-E-x(3)-N-E-x(1,3)-R-V-A-x-[ST]-P-x-[GST]-V-
  27.                     x(2)-L-x-[KRH]-x-G
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30.  
  31. -Consensus pattern: [LIVM](2)-G-[GA]-G-x-A-G-x(2)-[SA]-x(3)-[GA]-x-[SG]-
  32.                     [LIVM]-G-A-x-V-x(3)-D
  33. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  34. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  35.  
  36. -Last update: October 1993 / First entry.
  37.  
  38. [ 1] Delforge D., Depiereux E., de Bolle X., Feytmans E., Remacle J.
  39.      Biochem. Biophys. Res. Commun. 190:1073-1079(1993).
  40.